AT1G27480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.500 vacuole 0.500 ASURE: plasma membrane,vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha/beta-Hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: phosphatidylcholine-sterol O-acyltransferase activity; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lecithin:cholesterol acyltransferase (InterPro:IPR003386); Has 1076 Blast hits to 1070 proteins in 248 species: Archae - 0; Bacteria - 41; Metazoa - 667; Fungi - 0; Plants - 226; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 142 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9544607..9546168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48310.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 432 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKKISSHYSV VIAILVVVTM TSMCQAVGSN VYPLILVPGN GGNQLEVRLD REYKPSSVWC SSWLYPIHKK SGGWFRLWFD AAVLLSPFTR CFSDRMMLYY 101: DPDLDDYQNA PGVQTRVPHF GSTKSLLYLD PRLRDATSYM EHLVKALEKK CGYVNDQTIL GAPYDFRYGL AASGHPSRVA SQFLQDLKQL VEKTSSENEG 201: KPVILLSHSL GGLFVLHFLN RTTPSWRRKY IKHFVALAAP WGGTISQMKT FASGNTLGVP LVNPLLVRRH QRTSESNQWL LPSTKVFHDR TKPLVVTPQV 301: NYTAYEMDRF FADIGFSQGV VPYKTRVLPL TEELMTPGVP VTCIYGRGVD TPEVLMYGKG GFDKQPEIKY GDGDGTVNLA SLAALKVDSL NTVEIDGVSH 401: TSILKDEIAL KEIMKQISII NYELANVNAV NE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)