AT1G26340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome B5 isoform A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a member of the cytochromes b5 family of proteins that localizes to the outer envelope of the chloroplast. The C-terminal portion of the protein appears to be capable of inserting into a plant microsomal membrane in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome B5 isoform A (CB5-A); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b5, heme-binding site (InterPro:IPR018506), Cytochrome b5 (InterPro:IPR001199); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome B5 isoform B (TAIR:AT2G32720.1); Has 4207 Blast hits to 4178 proteins in 465 species: Archae - 2; Bacteria - 26; Metazoa - 1058; Fungi - 1672; Plants - 799; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 647 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9113992..9114755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15220.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 135 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPTLTKLYSM EEAATHNKQD DCWVVIDGKV YDVSSYMDEH PGGDDVLLAV AGKDATDDFE DAGHSKDARE LMEKYFIGEL DESSLPEIPE LKIYKKDQPQ 101: DSVQKLFDLT KQYWVVPVSI ITISVAVSVL FSRKT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)