AT1G26190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphoribulokinase / Uridine kinase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphoribulokinase / Uridine kinase family; FUNCTIONS IN: adenylate cyclase activity, kinase activity, phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor, ATP binding; INVOLVED IN: biosynthetic process, cAMP biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribulokinase/uridine kinase (InterPro:IPR006083), Uridine kinase (InterPro:IPR000764), Adenylate cyclase (InterPro:IPR008172); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoribulokinase / Uridine kinase family (TAIR:AT1G73980.1); Has 4771 Blast hits to 4715 proteins in 1747 species: Archae - 39; Bacteria - 3460; Metazoa - 396; Fungi - 136; Plants - 334; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 404 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:9057285..9060433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76011.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 674 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGQDSNGIEF HQKRHGLLKD QVQLVKRRDS IRYEIVSIQD RLSFEKGFFA VIRACQLLSQ KNDGIILVGV AGPSGAGKTV FTEKILNFLP SVAVISMDNY 101: NDSSRIVDGN FDDPRLTDYD TLLKNLEDLK EGKQVEVPIY DFKSSSRVGY RTLDVPPSRI VIIEGIYALS EKLRPLLDLR VSVTGGVHFD LVKRVLRDIQ 201: RAGQQPEEII HQISETVYPM YKAFIEPDLQ TAQIKIINKF NPFTGFQSPT YILKSRKEVS VDQIKAVLSD GHTETKEETY DIYLLPPGED PESCQSYLRM 301: RNKDGKYSLM FEEWVTDTPF VISPRITFEV SVRLLGGLMA LGYTIATILK RNSHVFATDK VFVKIDWLEQ LNRHYMQVQG KDRQLVQSTA EQLGLEGSFI 401: PRTYIEQIQL EKLINEVMAL PDDLKNKLSL DEDLVSSSSP KEALLRASAD RVAMRNKNLK RGMSHSYSTQ RDKNLSKLAG YSSSDRRYEE RNHDSPANEG 501: FMTLLSEQIS SLNERMDEFT SRIEELNSKL SCNKNSPTQQ SLSIQTEVCN GSAPTSYFIS GLDNGCLTNS IMPHSSSSSQ LAKDSPLMEE ISTISRGQRQ 601: VMHQLDNLCN LMRESSAERS RLARTGSSNS GNRGRSSKSS FLSNVESNKL PLVLTVAICS IGIIVIKSYI NKRQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)