AT1G24310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: nucleolus; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; Has 2922 Blast hits to 2454 proteins in 263 species: Archae - 0; Bacteria - 57; Metazoa - 1043; Fungi - 654; Plants - 388; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 769 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8624192..8626179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41819.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 377 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFGTPSSSPS FGTPSSTPAF GTSSPAFGTP SATPAFGTPS NPSFSSGGFG SSLFSSPFSS QQPQQQQQQQ QQQQPSSLFQ QQPSSNFGFQ SPFNNTAQQQ 101: QQTPFPNAQL TTQMAPVAPI PYSLADRDVQ AIIEAYKEDP TNPKYAFQHL LFSVTEPQYR VKPAAVSDIM WAEAMSKLEG MDSTERERLW PQLVQGFKDL 201: SQRLKLQDEV LVSDRDRIKT TQSNVKMLQR HLQASTFPSI ERLRQKEQSL QRRMLRVMRI IEGLEGKGFR LPLTKGEAEL SEKLTAITRQ VKGPGAELSR 301: RVQSLQTISR AQANSIAAGS SLYLPGSTKI DEQSLIDMQE VLQQETEAIG RLGNVLKRDM RDMEIMVAED TEMALDS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)