AT1G22940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : thiamin biosynthesis protein, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a bifunctional enzyme required for thiamine (vitamin B1) biosynthesis. TH1 can phosphorylate HMP-P to produce HMP-PP, the pyrimidine heterocyclic subunit of thiamine. TH1 also catalyzes the condensation of HMP-PP and HET to form thiamine monophosphate (TMP). TH1 also appears capable of phosphorylating HMP based on E.coli mutant complementation assays. th1 mutants are thiamine auxotrophs that die as seedlings on unsupplemented media. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
THIAMINE REQUIRING 1 (TH1); FUNCTIONS IN: phosphomethylpyrimidine kinase activity, thiamin-phosphate diphosphorylase activity, hydroxymethylpyrimidine kinase activity; INVOLVED IN: thiamin biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thiamine monophosphate synthase (InterPro:IPR003733), Phosphomethylpyrimidine kinase type-2 (InterPro:IPR004399), Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Phosphomethylpyrimidine kinase type-1 (InterPro:IPR013749); Has 15989 Blast hits to 15891 proteins in 2548 species: Archae - 338; Bacteria - 12149; Metazoa - 165; Fungi - 331; Plants - 107; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2899 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8122384..8124908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55816.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 522 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSLGGIRSW PANWRSTTAS MTTTESVRKV PQVLTVAGSD SGAGAGIQAD LKVCAARGVY CASVITAVTA QNTRGVQSVH LLPPEFISEQ LKSVLSDFEF 101: DVVKTGMLPS TEIVEVLLQN LSDFPVRALV VDPVMVSTSG HVLAGSSILS IFRERLLPIA DIITPNVKEA SALLDGFRIE TVAEMRSAAK SLHEMGPRFV 201: LVKGGDLPDS SDSVDVYFDG KEFHELRSPR IATRNTHGTG CTLASCIAAE LAKGSSMLSA VKVAKRFVDN ALDYSKDIVI GSGMQGPFDH FFGLKKDPQS 301: SRCSIFNPDD LFLYAVTDSR MNKKWNRSIV DALKAAIEGG ATIIQLREKE AETREFLEEA KACIDICRSH GVSLLINDRI DIALACDADG VHVGQSDMPV 401: DLVRSLLGPD KIIGVSCKTP EQAHQAWKDG ADYIGSGGVF PTNTKANNRT IGLDGLKEVC EASKLPVVAI GGIGISNAGS VMQIDAPNLK GVAVVSALFD 501: QDCVLTQAKK LHKTLKESKR GI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)