AT1G19700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BEL1-like homeodomain 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the BEL family of homeodomain proteins. Its interaction with PLP (PAS/LOV PROTEIN) is diminished by blue light. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BEL1-like homeodomain 10 (BEL10); FUNCTIONS IN: DNA binding, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent, regulation of transcription; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Homeobox (InterPro:IPR001356), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), POX (InterPro:IPR006563), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BEL1-like homeodomain 3 (TAIR:AT1G75410.2); Has 5190 Blast hits to 5190 proteins in 343 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 2115; Fungi - 347; Plants - 2475; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 249 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6809958..6811854 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60639.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 538 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVYYTSNVG CYQQEPIFLN HQQQNQQASS SSAAASFTVT GGDTVRNEMV FIPPTTTGDV VTGNGTVSSS DLSFHDGQGL SLSLGTQISV APFHFHQYQL 101: GFTSQNPSIS VKETSPFHVD EMSVKSKEMI LLGQSDPSSG YAGNGGNGFY NNYRYNETSG GFMSSVLRSR YLKPAQNLLD EVVSVKKELN QMGKKKMKVN 201: DFNSGSKEIE GGGGELSSDS NGKSIELSTI EREELQNKKN KLLTMVDEVD KRYNQYYHQM EALASSFEIV AGLGSAKPYT SVALNRISRH FRALRDAIKE 301: QIQIVREKLG EKGGESLDEQ QGERIPRLRY LDQRLRQQRA LHQQLGMVRP AWRPQRGLPE NSVSVLRAWL FEHFLHPYPK ESEKIMLAKQ TGLSKNQVAN 401: WFINARVRLW KPMIEEMYKE EFGDESELLI SKSSQEPNST NQEDSSSQQQ QQQENNNNSN LAYSSADTTN IVFSSETKPD RVLGNDNDPQ QQQINRSSDY 501: DTLMNYHGFG VDDYRYISGS NQQESRFSNS HHLHDFVV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)