AT1G19360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Reticulon (InterPro:IPR003388), Nucleotide-diphospho-sugar transferase, predicted (InterPro:IPR005069); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein (TAIR:AT1G75110.1); Has 297 Blast hits to 291 proteins in 24 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 280; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6690672..6692211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48253.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 428 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGRRDRSQQ LRGSRIAIAI LIGIFIGCVC AVLFPYGFFN SSSSLKASEH LSKSSNQVGS SACESPERVK MLKSDFVTLS EKNAELKKQV RELTEKLRLA 101: EQGSDNARKQ VLALGTQIKA GPFGTVKSLR TNPTILPDES INPRLAKILE EIAVDKEVIV ALANANVKAM LEVQIASIKR VGITNYLVVA LDDYIENLCK 201: ENDVAYYKRD PDKDVDTVGK TGGNHAVSGL KFRVLREFLQ LGYGVLLSDV DIVFLQNPFS HLYRDSDVES MSDGHDNHTA YGFNDVFDEP AMGWARYAHT 301: MRIWVFNSGF FYLRPTIPSI ELLDRVADRL SKAKVWDQAV FNEELFYPSH PEYTALHASK RVMDMYEFMN SKVLFKTVRK NHELKKKVKP VIVHVNYHPD 401: KLNRMQAVVE FYVNGKQDAL DSFPDGSE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)