AT1G17910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.652 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Wall-associated kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Wall-associated kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane; EXPRESSED IN: sperm cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Wall-associated kinase family protein (TAIR:AT1G19390.1); Has 115640 Blast hits to 113901 proteins in 3774 species: Archae - 105; Bacteria - 13025; Metazoa - 42944; Fungi - 9529; Plants - 32969; Viruses - 430; Other Eukaryotes - 16638 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6159126..6161615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85216.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 764 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRGNKNYYFL SLLYFLSLPI LHFSSCTHKC GDIQIPFPFG IGEIGCYLDE WYQVECRPSA TSGKVFPFLP KINMEVVNIS LPGTNDDIFY TYPSFSSIRV 101: KSPVASMGCS TDGNDSGLTL NFTETPFFFG DQNNLVAVGC NNKASLTNVE PTMVGCESTC TTSNNSRSIP FFNKVGCSGS VDSVTRDLLP KNYIPVCSTT 201: KIQDDTLICN GEGCCQAKAP VGSQQLIGVT ITNSTNGNLT KGGGCKVAFL TDEVYTLSNA TDPEQFFSKG VTVSLGWFIQ TKNHSFLQSL DCQNRGELDK 301: GKKRTRQCTC DNHIASGMGY ASCACASGYK GNPYVSDDCQ DINECTEYKN PCGDTRILYR NTCINTSGGH RCIDYHIPEV MLGLGAGFFV LIVGGGIWWW 401: RKLLRKRRMT NRKRKFFKRN GGLLLQQQLN TTQGRVEKTK LFSSRELEKA TDNFNDNRVI GQGGQGTVYK GMLVDGRSVA VKKSNVVDED KLQEFINEVI 501: ILSQINHRHV VKLLGCCLET EVPILVYEFI PNGNLFQHLH EEFDDYTALW GVRMRIAVDI SGAFSYLHTA ACSPIYHRDI KSTNILLDEK YRAKVSDFGT 601: SRSVSIDHTH WTTVISGTVG YVDPEYYGSS HFTEKSDVYS FGVVLVELIT GEKPVITLSE TQEITGLADY FRLAMRENRL FEIIDARIRN DCKLEQVIAV 701: ANLALRCLKK TGKTRPDMRE VSTALERICS APEDFQVQIQ IDEEDETTKL FRGYSGSTEI ARSM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)