AT1G16570.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.576 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, group 1 (InterPro:IPR001296); Has 834 Blast hits to 816 proteins in 377 species: Archae - 30; Bacteria - 354; Metazoa - 141; Fungi - 141; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 118 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5670763..5673423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52323.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKRGRACVV VLGDLGRSPR MQYHALSLAR QASFQVDIVA YGGSIPHEAV LNHPSIHIHT MAQPRFIQYF PKILYPVTLL LKAFIQFTML LWFLFVKVPA 101: PDIFLVQNPP SVPTLIAVKW ASSWRRAAFV VDWHNFGYTL LALSLGRNNL LVSLYRWSEN HYGKMATGSL CVTKAMQHEL DQNWGVRAKV LYDQPPEFFR 201: PALLEERHEL FCRVRKDLCH PIGVYDFISR ELENQELNET LFTTKFNADI SLKQNRPALV VSSTSWTPDE NFGILLEAAV MYDRRVAARS KGSETAEISE 301: EQHHYPNLLF IITGKGPEKE MYEEKIKRLN LRHVAFRTMW LAAEDYPLLL GSADLGVCLH TSSSGLDLPM KVVDMFGCGL PVCSVSYSCI QELVKDGKNG 401: LLFSSSSELA DQLLILFKGF PGNCDALMSL KAGAMETGSS GRWATEWEDC AKPLITQVVS QIADS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)