AT1G16130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.865 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : wall associated kinase-like 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
wall-associated kinase like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
wall associated kinase-like 2 (WAKL2); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: integral to membrane; EXPRESSED IN: stem, cotyledon, leaf whorl, leaf; EXPRESSED DURING: LP.06 six leaves visible, LP.04 four leaves visible, LP.10 ten leaves visible, LP.08 eight leaves visible, LP.12 twelve leaves visible; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wall associated kinase-like 4 (TAIR:AT1G16150.1); Has 122559 Blast hits to 120935 proteins in 4599 species: Archae - 125; Bacteria - 14250; Metazoa - 44921; Fungi - 10430; Plants - 34238; Viruses - 502; Other Eukaryotes - 18093 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5525634..5528047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83361.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 748 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKTETHNRQC IPLAISVLSL FINGVSSARQ PPDRCNRVCG EISIPFPFGI GGKDCYLNPW YEVVCNSTNS VPFLSRINRE LVNISLNGVV HIKAPVTSSG 101: CSTGTSQPLT PPPLNVAGQG SPYFLTDKNL LVAVGCKFKA VMAGITSQIT SCESSCNERN SSSQEGRNKI CNGYKCCQTR IPEGQPQVIS VDIEIPQGNN 201: TTGEGGCRVA FLTSDKYSSL NVTEPEKFHG HGYAAVELGW FFDTSDSRDT QPISCKNASD TTPYTSDTRC SCSYGYFSGF SYRDCYCNSP GYKGNPFLPG 301: GCVDVDECKL DIGRNQCKDQ SCVNLPGWFD CQPKKPEQLK RVIQGVLIGS ALLLFAFGIF GLYKFVQKRR KLIRMRKFFR RNGGMLLKQQ LARKEGNVEM 401: SRIFSSHELE KATDNFNKNR VLGQGGQGTV YKGMLVDGRI VAVKRSKAVD EDRVEEFINE VVVLAQINHR NIVKLLGCCL ETEVPVLVYE FVPNGDLCKR 501: LHDESDDYTM TWEVRLHIAI EIAGALSYLH SAASFPIYHR DIKTTNILLD ERNRAKVSDF GTSRSVTIDQ THLTTQVAGT FGYVDPEYFQ SSKFTEKSDV 601: YSFGVVLVEL LTGEKPSSRV RSEENRGLAA HFVEAVKENR VLDIVDDRIK DECNMDQVMS VANLARRCLN RKGKKRPNMR EVSIELEMIR SSHYDSGIHI 701: EDDDEEDDQA MELNFNDTWE VGATAPASMF NNASPTSDAE PLVPLRTW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)