AT1G15700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATPase, F1 complex, gamma subunit protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of two genes that encode the gamma subunit of Arabidopsis chloroplast ATP synthase. It is thought to be involved in the regulation of the ATP synthase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATPC2; FUNCTIONS IN: enzyme regulator activity; INVOLVED IN: ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: chloroplast ATP synthase complex, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F1 complex, gamma subunit (InterPro:IPR000131); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATPase, F1 complex, gamma subunit protein (TAIR:AT4G04640.1); Has 9547 Blast hits to 9544 proteins in 2715 species: Archae - 5; Bacteria - 5540; Metazoa - 280; Fungi - 148; Plants - 177; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3397 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5402629..5403789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42681.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 386 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTGSISTSWL LSSPSNSNSA SSSESYSFIA TLKPVRYYPF QSLTPNRISS RSPLPSIQIR AGIRELRERI DSVKNTQKIT EAMRLVAAAR VRRAQDAVIK 101: GRPFTETLVE ILYSINQSAQ LEDIDFPLSI VRPVKRVALV VVTGDKGLCG GFNNAVTKKA TLRVQELKQR GIDCVVISVG KKGNAYFSRR DEFDVDKCIE 201: GGGVFPTTKE AQVIADDVFS LFVSEEVDKV ELVYTKFVSL VKSDPVIHTL LPLSMKGESC DVKGECVDAI EDEMFRLTSK DGKLAVERTK LEVEKPEISP 301: LMQFEQDPVQ ILDAMMPLYL NSQILRALQE SLASELASRM NAMSNATDNA VELKKNLTMA YNRARQAKIT GELLEIVAGA EALRES |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)