AT1G14670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Endomembrane protein 70 protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Endomembrane protein 70 protein family; INVOLVED IN: transport; LOCATED IN: integral to membrane, Golgi apparatus, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nonaspanin (TM9SF) (InterPro:IPR004240); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Endomembrane protein 70 protein family (TAIR:AT2G01970.1); Has 1574 Blast hits to 1525 proteins in 319 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 610; Fungi - 249; Plants - 451; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 262 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5037669..5040199 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68087.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 592 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRTPTTILLL VGAILFSGAG YVRSDASDHR YKEGDTVPLY ANKVGPFHNP SETYRYFDLP FCIPEGVKEK KEALGEVLNG DRLVSAPYKL NFRDEKESEV 101: YCNKKLSKEE VKQFRKAVEK DYYFQMYYDD LPIWGFIGKV DKDIKSDPSE FKYFLYKHIQ FEILYNKDRV IEISARMDPH SLVDLTEDKE VDAEFMYTVK 201: WKETETPFEK RMEKYSMSSS LPHHLEIHWF SIINSCVTVL LLTGFLATIL MRVLKNDFMK YAQDEEAADD QEETGWKYIH GDVFRFPTHN SLFAASLGSG 301: TQLFTLTIFI FMLALVGVFY PYNRGALFTA LVVIYALTSG IAGYTSASFY CQLEGKSWVR NLLLTGCLFC GPLFLTFCFL NTVAITYTAT AALPFGTIVV 401: IVLIWTLVTS PLLVLGGIAG KNSKAEFQAP CRTTKYPREI PPLPWYRSAI PQMAMAGFLP FSAIYIELYY IFASVWGHRI YTIYSILFIV FIILIIVTAF 501: ITVALTYFQL AAEDHQWWWR SFLCGGSTGL FIYAYCLYYY YARSDMSGFM QTSFFFGYMA CICYGFFLML GTVGFRAALL FVRHIYRSIK CE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)