AT1G14530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF1084) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
TOM THREE HOMOLOG 1 (THH1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1084 (InterPro:IPR009457); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: tobamovirus multiplication protein 3 (TAIR:AT2G02180.1); Has 257 Blast hits to 256 proteins in 45 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 202; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 55 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4971420..4973597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34050.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 293 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRSGGLEMMS SSAIVAFNLK EGKNWWWDVN ESPVWQDRIF HVLAVLYGIV SVIAVIQLVR IQLRVPEYGW TTQKVFHFLN FMVNGVRALV FLFRRDAQNM 101: QPEILQHILL DIPSLAFFTT YALLVLFWAE IYYQARAVST DGLRPSFFTI NAVVYVIQIA LWLVLWWKPV HLMVIISKMF FAGVSLFAAL GFLLYGGRLF 201: LMLQRFPVES KGRRKKLQEV GYVTTICFTC FLIRCIMMCF DAFDDAADLD VLDHPILNFI YYLLVEILPS SLVLFILRKL PPKRGITQYH QIQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)