AT1G14360.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-galactose transporter 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-galactose transporter 3 (UTR3); FUNCTIONS IN: pyrimidine nucleotide sugar transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transmembrane transport; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UAA transporter (InterPro:IPR013657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-galactose transporter 1 (TAIR:AT2G02810.1); Has 1048 Blast hits to 1040 proteins in 233 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 487; Fungi - 154; Plants - 232; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 175 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4911362..4913029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36719.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESHGSGLRR VLLLSFCVAG IWAAYIYQGI LQETLSTKKF GEDGKRFEHL AFLNLAQNVI CLVWSYIMIK LWSNGGSGGA PWWTYWSAGI TNTIGPAMGI 101: EALKYISYPA QVLAKSSKMI PVMLMGSLVY GIRYTLPEYL CTFLVAGGVS MFALLKTSSK TISKLAHPNA PLGYGLCFLN LAFDGFTNAT QDSITARYPK 201: TNAWDIMLGM NLWGTIYNMV YMFGLPHGSG FEAVQFCKQH PEAAWDILMY CLCGAVGQNF IFLTISRFGS LANTTITTTR KFVSIVVSSV LSGNPLSSKQ 301: WGCVSMVFGG LSYQIYLKWR KLQRMQKKKK A |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)