AT1G13420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.372 nucleus 0.309 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfotransferase 4B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sulfotransferase. Unlike the related ST4A protein (At2g14920), in vitro experiements show that this enzyme does not act brassinosteroids. ST4B is expressed in the roots and transcript levels rise in response to cytokinin treatment. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfotransferase 4B (ST4B); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulfotransferase domain (InterPro:IPR000863); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfotransferase 4A (TAIR:AT2G14920.1); Has 2771 Blast hits to 2728 proteins in 191 species: Archae - 0; Bacteria - 215; Metazoa - 1679; Fungi - 1; Plants - 543; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 333 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4604871..4605866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37710.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEKDIPRNL KEEEEEEEEN QSEETKSLIS SLPSDIDCSG TKLYKYQGCW YDKDILQAIL NFNKNFQPQE TDIIVASFPK SGTTWLKALT FALAQRSKHT 101: SDNHPLLTHN PHELVPYLEL DLYLKSSKPD LTKLPSSSPR LFSTHMSFDA LKVPLKESPC KIVYVCRNVK DVLVSLWCFE NSMSGENNLS LEALFESLCS 201: GVNLCGPLWE NVLGYWRGSL EDPKHVLFLR YEELKTEPRV QIKRLAEFLD CPFTKEEEDS GGVDKILELC SLRNLSGLEI NKTGSLSEGV SFKSFFRKGE 301: VGDWKSYMTP EMENKIDMIV EEKLQGSGLK L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)