AT1G13080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.843 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cytochrome P450 monooxygenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 2 (CYP71B2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: response to cyclopentenone, heat acclimation; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 20 (TAIR:AT3G26180.1); Has 33312 Blast hits to 33067 proteins in 1707 species: Archae - 47; Bacteria - 3450; Metazoa - 12035; Fungi - 6950; Plants - 9630; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1197 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4459212..4460807 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57143.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 502 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTILLCFFLV SLLTIVSSIF LKQNKTSKFN LPPSPSSLPI IGNLHHLAGL PHRCFHKLSI KYGPLVFLRL GSVPVVVISS SEAAEAVLKT NDLECCSRPK 101: TVGSGKLSYG FKDITFAPYG EYWREVRKLA VIELFSSKKV QSFRYIREEE VDFVVKKVSE SALKQSPVDL SKTFFSLTAS IICRVALGQN FNESGFVIDQ 201: DRIEELVTES AEALGTFTFS DFFPGGLGRF VDWLFQRHKK INKVFKELDA FYQHVIDDHL KPEGRKNQDI VTLILDMIDK QEDSDSFKLN MDNLKAIVMD 301: VFLAGIDTSA VTMIWAMTEL IRNPRVMKKA QESIRTTLGL KKERITEEDL GKVEYLNHIL KETFRLHPAL PFVVPRETMS HIKIQGYDIP PKTQIQLNVW 401: TIGRDPKRWN DPEEFNPERF ANSSVDFRGQ HFDLLPFGSG RRICPGMPMA IASVELALMN LLYYFDWSMP DGTKGEDIDM EEAGNISIVK KIPLQLVPVQ 501: RY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)