AT1G11790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arogenate dehydratase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plastid-localized arogenate dehydratase involved in phenylalanine biosynthesis. Not less than six genes encoding ADT were identified in the Arabidopsis genome: ADT1 [At1g11790]; ADT2 [At3g07630]; ADT3 [At2g27820]; ADT4 [At3g44720]; ADT5 [At5g22630]; and ADT6 [At1g08250]. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arogenate dehydratase 1 (ADT1); FUNCTIONS IN: arogenate dehydratase activity, prephenate dehydratase activity; INVOLVED IN: L-phenylalanine biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prephenate dehydratase (InterPro:IPR001086), Amino acid-binding ACT (InterPro:IPR002912), Prephenate dehydratase, conserved site (InterPro:IPR018528); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: arogenate dehydratase 2 (TAIR:AT3G07630.2); Has 7165 Blast hits to 7163 proteins in 2224 species: Archae - 179; Bacteria - 3955; Metazoa - 5; Fungi - 120; Plants - 260; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2646 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3981476..3984962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43607.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 392 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALRCFPIWV CPQTTHHRSP LMGLAEFDAD KRRRFCLWEC SSSASQRAVT AIEGEIPFSR ELKKSSDELG LTQETQSLSF HRDLSMLPKP LTANSLYSSD 101: GDDSKVRISF QGIPGAYSET AALKAFPNCE TVPCEQFEAA FQAVELWLVD KAVLPIENSV GGSIHRNYDL LLRHRLHIVQ EVHLPVNHCL LGVPGVKKED 201: IKCVLSHPQA LDQCVNSLNN LGIQRISAKD TATAAQTVSS SGKIDVGAIA SVRAANIYGL DILAENIQDD VNNVTRFLIL AREPMIPRTD RPYKTSIVFS 301: LEEGPGVLFK ALAVFALRSI NLSKIESRPQ RRRPLRVVDG SNNGSAKYFD YLFYIDFEAS MADTRAQHAL GHLQEFASFI RILGCYPMDL VR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)