AT1G11730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.544 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Galactosyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: protein amino acid glycosylation; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT1G05170.2); Has 1454 Blast hits to 1447 proteins in 96 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 839; Fungi - 2; Plants - 587; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 26 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3957473..3960113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43624.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 384 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSFKNRGDYN FTPRNVVSRN SVFFMCLASF CLGMFFTNRM WNIVPEARGI SRLSKLSLSS SDCDKKNVLD YGNNTIGILD KSISNLEMKL VAARAERESL 101: SGKFNISNEA KKRKYFMVIG INTAFSSRKR RDSVRSTWMP QGENLKKLEE EKGIIVRFVI GHSVLSHGIL DKAIEAEEKT HGDFLRLEHT EGYMKLSAKT 201: KTFFATAVSL WDAEFYIKVD DDVHVNLASL KKALSAHQNK PRVYVGCMKS GPVLARKSVK YHEPEYWKFG EVGNKYFRHA TGQFYAISKD LATYILINQD 301: LLHKYANEDV SLGSWFIGLN VEHVDEKRLC CSTSQDCELK AMMGHVCAAS FDWKCSGICR SAERMADVHE RCGEPQNALW TSNS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)