AT1G11580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methylesterase PCR A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
methylesterase PCR A (PMEPCRA); FUNCTIONS IN: enzyme inhibitor activity, pectinesterase activity; INVOLVED IN: cell wall modification; LOCATED IN: cell wall, plasma membrane, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pectinesterase, active site (InterPro:IPR018040), Pectin lyase fold/virulence factor (InterPro:IPR011050), Pectinesterase inhibitor (InterPro:IPR006501), Pectinesterase, catalytic (InterPro:IPR000070), Pectin lyase fold (InterPro:IPR012334); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily (TAIR:AT1G11590.1); Has 3127 Blast hits to 3075 proteins in 484 species: Archae - 6; Bacteria - 913; Metazoa - 1; Fungi - 197; Plants - 1984; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 26 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3888730..3890649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61690.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 557 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNSNQPLLS KPKSLKHKNL CLVLSFVAIL GSVAFFTAQL ISVNTNNNDD SLLTTSQICH GAHDQDSCQA LLSEFTTLSL SKLNRLDLLH VFLKNSVWRL 101: ESTMTMVSEA RIRSNGVRDK AGFADCEEMM DVSKDRMMSS MEELRGGNYN LESYSNVHTW LSSVLTNYMT CLESISDVSV NSKQIVKPQL EDLVSRARVA 201: LAIFVSVLPA RDDLKMIISN RFPSWLTALD RKLLESSPKT LKVTANVVVA KDGTGKFKTV NEAVAAAPEN SNTRYVIYVK KGVYKETIDI GKKKKNLMLV 301: GDGKDATIIT GSLNVIDGST TFRSATVAAN GDGFMAQDIW FQNTAGPAKH QAVALRVSAD QTVINRCRID AYQDTLYTHT LRQFYRDSYI TGTVDFIFGN 401: SAVVFQNCDI VARNPGAGQK NMLTAQGRED QNQNTAISIQ KCKITASSDL APVKGSVKTF LGRPWKLYSR TVIMQSFIDN HIDPAGWFPW DGEFALSTLY 501: YGEYANTGPG ADTSKRVNWK GFKVIKDSKE AEQFTVAKLI QGGLWLKPTG VTFQEWL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)