AT1G10840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : translation initiation factor 3 subunit H1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes eukaryotic initiation factor 3H1 subunit (TIF3H1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translation initiation factor 3 subunit H1 (TIF3H1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mov34/MPN/PAD-1 (InterPro:IPR000555); Has 1300 Blast hits to 1299 proteins in 247 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 532; Fungi - 366; Plants - 231; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 171 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3607885..3610299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38374.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 337 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATMARSFLQ AISKDEAVAP PLRVVQIEGL AVLKIIKHCK EFSPTLVTGQ LLGLDVGSVL EVTNCFPFPV RDDDEEIEAD GANYQLEMMR CLREVNVDNN 101: TVGWYQSTVL GSYQTVELIE TFMNYQENIK RCVCIIYDPS KADLGVLALK ALKLSDSFME LYRGGNFTGE KLREKNFSWM DIFEEIPIKV SNSALVSAFM 201: TELETDTPVS QGDYDRLHSS TTPFLENNME FLIKCMDDLS MEQQKFQYYY RNLSRQQAQQ QAWLQKRRTE NMARKSAGEE PLPEEDPSNP IFKAIPEPSR 301: LESFLITNQV SNFCGQINGV AGQNFSRLYL TKALHDN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)