AT1G10520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNA polymerase lambda (POLL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DNA polymerase lambda (POLL); FUNCTIONS IN: DNA binding, DNA-directed DNA polymerase activity, catalytic activity, nucleotidyltransferase activity; INVOLVED IN: DNA repair, DNA replication; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleotidyl transferase domain (InterPro:IPR002934), DNA-directed DNA polymerase, family X, beta-like (InterPro:IPR002008), DNA-directed DNA polymerase, family X, beta-like, N-terminal (InterPro:IPR010996), DNA polymerase lambda, fingers domain (InterPro:IPR018944), DNA polymerase family X, binding site (InterPro:IPR019843), DNA-directed DNA polymerase X (InterPro:IPR002054), BRCT (InterPro:IPR001357), DNA polymerase X (InterPro:IPR022312); Has 1887 Blast hits to 1879 proteins in 557 species: Archae - 50; Bacteria - 688; Metazoa - 533; Fungi - 209; Plants - 50; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 350 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3465964..3469248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59590.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 529 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAKRGRNRS PSPDPEGMFA GMVVFMVEIG VQRRRLQIWK QKLVQMGAVI EEDRVTKKVT HVLAMNLEAL LHKFGKERLS HFTARLMLYQ WLEDSLTSGE 101: KANEDLYVLK IDSEEVDKPK KSLPAISGSE DQSSPQKRTR YSPDAGDFKG VESHSNTQGS PDSPTSCSVP STSASPGEGI AETPTSPQSE STSVYKPPDL 201: NRNITEIFGK LINIYRALGE DRRSFSYYKA IPVIEKFPTR IESVDQLKHL PGIGKAMRDH IQEIVTTGKL SKLEHFETDE KVRTISLFGE VWGVGPATAL 301: KLYEKGHRTL EDLKNEDSLT HAQKLGLKYF DDIKTRIPRQ EVQEMEQLLQ RVGEETLPGV NIVCGGSYRR GKATCGDLDI VVTHPDGQSH KGFLTKFVKR 401: LKEMNFLRED LIFSTHSEEG TDSGVDTYFG LCTYPGQELR RRIDFKVYPR DIYSFGLIAW TGNDVLNRRL RLLAESKGYR LDDTGLFPAT HSSSGNRGAR 501: GTASLKLSTE KQVFDFLGFP WLEPHERNL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)