AT1G09450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719); Has 302 Blast hits to 302 proteins in 127 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 120; Fungi - 113; Plants - 37; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 32 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3049066..3052858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67933.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 599 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGQRVDLWSE VIKSEEEDGD IPKIEAVFQR RKKPDKSSEA VNFGWLVKGA RTSSVNGPKR DSWARSLSTR GRESIAVRAY VNNQPQKKAA GRKKPPIPKG 101: KVVKAPDFQK EKEYFRDIDA FELLEESPSP NKSSTWTMGE QVVPEMPHLS TRLEKWLISK KLNHTCGPSS TLSKILENSA IHQESVCDND AFDSLSLKTP 201: DKSSAGNTSV FRLIPSCDEN LAAEDVPVRK IKMESIDLED ELKRLSLTSD LIPTHQDFDQ PILDLLSACG QMRPSNFIEA FSKFCEPESI VKIGEGTYGE 301: AFRAGSSVCK IVPIDGDFRV NGEVQKRADE LLEEVILSWT LNQLRECETT AQNLCPTYIK TQDIKLCQGP YDPILIKAWE EWDAKHGSEN DHPDFPEKQC 401: YVMFVLEHGG KDLESFVLLN FDEARSLLVQ ATAGLAVAEA AFEFEHRDLH WGNILLSRNN SDTLPFILEG KQVCIKTFGV QISIIDFTLS RINTGEKILF 501: LDLTSDPYLF KGPKGDKQSE TYRKMKAVTE DYWEGSFART NVLWLIYLVD ILLTKKSFER SSKHERELRS LKKRMEKYES AKEAVSDPFF SDMLMDQIS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)