AT1G08630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : threonine aldolase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a threonine aldolase, involved in threonine degradation to glycine. Primarily expressed in seeds and seedlings. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
threonine aldolase 1 (THA1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase (InterPro:IPR001597), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: threonine aldolase 2 (TAIR:AT3G04520.1); Has 4107 Blast hits to 4101 proteins in 1235 species: Archae - 29; Bacteria - 2521; Metazoa - 93; Fungi - 250; Plants - 87; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1127 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2743948..2745685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38944.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 358 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVMRSVDLRS DTVTRPTDAM REAMCNAEVD DDVLGYDPTA RRLEEEMAKM MGKEAALFVP SGTMGNLISV MVHCDVRGSE VILGDNCHIH VYENGGISTI 101: GGVHPKTVKN EEDGTMDLEA IEAAIRDPKG STFYPSTRLI CLENTHANSG GRCLSVEYTE KVGEIAKRHG VKLHIDGARL FNASIALGVP VHKLVKAADS 201: VQVCLSKGLG APVGSVIVGS QSFIEKAKTV RKTLGGGMRQ IGVLCAAALV ALQENLPKLQ HDHKKAKLLA EGLNQMKGIR VNVAAVETNM IFMDMEDGSR 301: LTAEKLRKNL EENGILLIRG NSSRIRIVIH HQITTSDVHY TLSCFQQAML TMQEPSRT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)