AT1G08510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fatty acyl-ACP thioesterases B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an acyl-acyl carrier protein thioesterase. Hydrolyzes primarily saturated acyl-ACPs with chain lengths that vary between 8 and 18 carbons. Involved in saturated fatty acid synthesis. Nuclear-encoded, plastid-targeted globular protein that is functional as dimer. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fatty acyl-ACP thioesterases B (FATB); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acyl-ACP-thioesterase, N-terminal domain (InterPro:IPR021113), Acyl-ACP thioesterase (InterPro:IPR002864); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fatA acyl-ACP thioesterase (TAIR:AT3G25110.1); Has 1275 Blast hits to 1274 proteins in 533 species: Archae - 0; Bacteria - 944; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 322; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2691546..2693409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45689.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 412 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVATSATSSF FPVPSSSLDP NGKGNKIGST NLAGLNSAPN SGRMKVKPNA QAPPKINGKK VGLPGSVDIV RTDTETSSHP APRTFINQLP DWSMLLAAIT 101: TIFLAAEKQW MMLDWKPRRS DMLVDPFGIG RIVQDGLVFR QNFSIRSYEI GADRSASIET VMNHLQETAL NHVKTAGLLG DGFGSTPEMF KKNLIWVVTR 201: MQVVVDKYPT WGDVVEVDTW VSQSGKNGMR RDWLVRDCNT GETLTRASSV WVMMNKLTRR LSKIPEEVRG EIEPYFVNSD PVLAEDSRKL TKIDDKTADY 301: VRSGLTPRWS DLDVNQHVNN VKYIGWILES APVGIMERQK LKSMTLEYRR ECGRDSVLQS LTAVTGCDIG NLATAGDVEC QHLLRLQDGA EVVRGRTEWS 401: SKTPTTTWGT AP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)