AT1G07510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FTSH protease 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an FtsH protease that is localized to the mitochondrion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FTSH protease 10 (ftsh10); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: proteolysis, protein catabolic process; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast thylakoid membrane, plastid; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M41, FtsH (InterPro:IPR005936), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), ATPase, AAA-type, conserved site (InterPro:IPR003960), Peptidase M41 (InterPro:IPR000642), Peptidase M41, FtsH extracellular (InterPro:IPR011546); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FTSH protease 3 (TAIR:AT2G29080.1); Has 37747 Blast hits to 35440 proteins in 3262 species: Archae - 1533; Bacteria - 14237; Metazoa - 4767; Fungi - 3643; Plants - 3223; Viruses - 27; Other Eukaryotes - 10317 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2305689..2309380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 89559.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 813 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIFSKLGSSL ARSSRSKGFV YGGGVRSAVF NQGRLRAPQN LEAAVNQVDG GLGFLRRHFA SFAARKGLEA GDLSRAFANP RLRRFFSSQT PKKKNYENYY 101: PKDSKKAPKN EQKSESRDGS KKNENENAGD AFSNEYQNML IPLMAIALIL STFSLGSREQ QQISFQEFKN KLLEAGLVDH IDVSNKEVAK VYVRSSPKSQ 201: TTEEVVQGPG NGVPAKGRGG QYKYYFNIGS VESFEEKLEE AQEAIGVNSH DFVPVTYVSE TIWYQELLRF APTLLLVATL IFGARRMQGG LGGLGGPGGK 301: AGRGIFNIGK AQITRADKNS KNKIYFKDVA GCEEAKQEIM EFVHFLQNPK KYEDLGAKIP KGALLVGPPG TGKTLLAKAT AGESAVPFLS ISGSDFMEMF 401: VGVGPSRVRN LFQEARQCAP SIIFIDEIDA IGRARGRGGF SGGNDEREST LNQLLVEMDG FGTTAGVVVL AGTNRPDILD KALLRPGRFD RQITIDKPDI 501: KGRDQIFQIY LKKIKLDHEP SYYSQRLAAL TPGFAGADIA NVCNEAALIA ARHEGATVTM AHFDSAIDRV IGGLEKKNRV ISKLERRTVA YHESGHAVAG 601: WFLEHAEPLL KVTIVPRGTA ALGFAQYVPN ENLLMTKEQL FDMTCMTLGG RAAEQVLIGR ISTGAQNDLE KVTKMTYAQV AVYGFSDKIG LLSFPQREDE 701: FSKPYSNRTG AMIDEEVREW VGKAYKRTVE LIEEHKEQVA QIAELLLEKE VLHQDDLTKV LGERPFKSGE TTNYDRFKSG FEESEKESQK ESVPVKPVED 801: DGIPPLEPQV VPT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)