AT1G06890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF250 (InterPro:IPR004853); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleotide/sugar transporter family protein (TAIR:AT2G30460.2); Has 2654 Blast hits to 2649 proteins in 293 species: Archae - 2; Bacteria - 105; Metazoa - 662; Fungi - 435; Plants - 1177; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 273 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2111728..2114038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39040.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 357 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSEGQKFQLG TIGALSLSVV SSVSIVICNK ALISTLGFTF ATTLTSWHLL VTFCSLHVAL WMKMFEHKPF DPRAVMGFGI LNGISIGLLN LSLGFNSVGF 101: YQMTKLAIIP CTVLLETLFF RKKFSRKIQF SLTILLLGVG IATVTDLQLN MLGSVLSLLA VVTTCVAQIM TNTIQKKFKV SSTQLLYQSC PYQAITLFVT 201: GPFLDGLLTN QNVFAFKYTS QVVFFIVLSC LISVSVNFST FLVIGKTSPV TYQVLGHLKT CLVLAFGYVL LRDPFDWRNI LGILVAVIGM VVYSYYCSIE 301: TQQKASETST QLPQMKESEK DPLIAAENGS GVLSDGGGGV QQKTVAPVWN SNKDFQA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)