AT1G03870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FASCICLIN-like arabinoogalactan 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
fasciclin-like arabinogalactan-protein 9 (Fla9) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FASCICLIN-like arabinoogalactan 9 (FLA9); LOCATED IN: anchored to plasma membrane, plasma membrane, anchored to membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAS1 domain (InterPro:IPR000782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FASCICLIN-like arabinogalactan protein 13 precursor (TAIR:AT5G44130.1); Has 1005 Blast hits to 985 proteins in 182 species: Archae - 18; Bacteria - 304; Metazoa - 15; Fungi - 9; Plants - 624; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 35 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:982625..983368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26116.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 247 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTRLTLAP LLLIAAVLLA TKATAQPAAP APEPAGPINL TAILEKGGQF TTFIHLLNIT QVGSQVNIQV NSSSEGMTVF APTDNAFQNL KPGTLNQLSP 101: DDQVKLILYH VSPKYYSMDD LLSVSNPVRT QASGRDNGVY GLNFTGQTNQ INVSTGYVET RISNSLRQQR PLAVYVVDMV LLPGEMFGEH KLSPIAPAPK 201: SKSGGVTDDS GSTKKAASPS DKSGSGEKKV GLGFGLGLIV LCLKFLF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)