AT1G02410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome c oxidase assembly protein CtaG / Cox11 family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome c oxidase assembly protein CtaG / Cox11 family; FUNCTIONS IN: copper ion binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11 (InterPro:IPR007533); Has 2749 Blast hits to 2749 proteins in 659 species: Archae - 0; Bacteria - 997; Metazoa - 98; Fungi - 130; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1483 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:491300..492762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32606.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 287 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSWSKACRGT RISSYLENLH RTSQYPRTIL CSRYYTHGAC KSNEHYLRSK RVFWGSSSSW SLNSHSATAK SMLDSAHRQY STHSPSETKS QKMLYYLTAV 101: VFGMVGLTYA AVPLYRTFCQ ATGYGGTVQR KETVEEKIAR HSESGTVTER EIVVQFNADV ADGMQWKFTP TQREVRVKPG ESALAFYTAE NKSSAPITGV 201: STYNVTPMKA GVYFNKIQCF CFEEQRLLPG EQIDMPVFFY IDPEFETDPR MDGINNLILS YTFFKVSEEN TTETVNNNNS VPVQETN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)