AT1G01900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : subtilase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AtSBT1.1, a subtilisin-like serine protease. Cleaves the phytosulfokine AtPSK4, a growth promoting peptide. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SBTI1.1; FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, negative regulation of catalytic activity; LOCATED IN: extracellular matrix, apoplast, cell wall; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Subtilase family protein (TAIR:AT5G67360.1); Has 6944 Blast hits to 6289 proteins in 1039 species: Archae - 198; Bacteria - 3931; Metazoa - 46; Fungi - 433; Plants - 1873; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 463 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:310332..313011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83251.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 774 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHRFLLMLLF PFSDNRPMMF FRSFIVFFFL IFFASNVSSR KQTYVIHTVT TSTKHIVTSL FNSLQTENIN DDDFSLPEIH YIYENAMSGF SATLTDDQLD 101: TVKNTKGFIS AYPDELLSLH TTYSHEFLGL EFGIGLWNET SLSSDVIIGL VDTGISPEHV SFRDTHMTPV PSRWRGSCDE GTNFSSSECN KKIIGASAFY 201: KGYESIVGKI NETTDFRSTR DAQGHGTHTA STAAGDIVPK ANYFGQAKGL ASGMRFTSRI AAYKACWALG CASTDVIAAI DRAILDGVDV ISLSLGGSSR 301: PFYVDPIAIA GFGAMQKNIF VSCSAGNSGP TASTVSNGAP WLMTVAASYT DRTFPAIVRI GNRKSLVGSS LYKGKSLKNL PLAFNRTAGE ESGAVFCIRD 401: SLKRELVEGK IVICLRGASG RTAKGEEVKR SGGAAMLLVS TEAEGEELLA DPHVLPAVSL GFSDGKTLLN YLAGAANATA SVRFRGTAYG ATAPMVAAFS 501: SRGPSVAGPE IAKPDIAAPG LNILAGWSPF SSPSLLRSDP RRVQFNIISG TSMACPHISG IAALIKSVHG DWSPAMIKSA IMTTARITDN RNRPIGDRGA 601: AGAESAATAF AFGAGNVDPT RAVDPGLVYD TSTVDYLNYL CSLNYTSERI LLFSGTNYTC ASNAVVLSPG DLNYPSFAVN LVNGANLKTV RYKRTVTNVG 701: SPTCEYMVHV EEPKGVKVRV EPKVLKFQKA RERLSYTVTY DAEASRNSSS SSFGVLVWIC DKYNVRSPIA VTWE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)