AT1G01290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cofactor of nitrate reductase and xanthine dehydrogenase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
COFACTOR OF NITRATE REDUCTASE AND XANTHINE DEHYDROGENASE 3. Encodes a protein involved in molybdenum cofactor biosynthesis. Homologous to E.coli MoaC. Expression is low in all tissues examined, except in roots. Appears to have targeting signals for chloroplast or mitochondria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cofactor of nitrate reductase and xanthine dehydrogenase 3 (CNX3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molybdopterin cofactor biosynthesis C (MoaC) domain (InterPro:IPR002820); Has 5242 Blast hits to 5240 proteins in 1916 species: Archae - 213; Bacteria - 3669; Metazoa - 104; Fungi - 75; Plants - 45; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1136 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:114299..115296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29514.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 270 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MISTLRRAVF LRRFPAVVSP IKRAFSSRID DEFDPQIMNI NELNQEMQSI FGQEPSPDGP GTMDFSELKS SKIEPLRSKN IDFRQQIEYH KSTHSSKNDS 101: QAIEQYAKVA SDMSKLTHVG IAGEAQMVDV SSKDNSKRTA LACCKVILGK RVFDLVLANQ MGKGDVLGVA KIAGINGAKQ TSSLIPLCHN IALTHVRVDL 201: RLNPEDFSVD IEGEASCTGK TGVEMEAMTA VSVAGLTVYD MCKAASKDIS ITDVRLERKT GGKSGSWSRL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)