AT1G01050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pyrophosphorylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a soluble protein with inorganic pyrophosphatase activity that is highly specific for Mg-inorganic pyrophosphate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pyrophosphorylase 1 (PPa1); FUNCTIONS IN: inorganic diphosphatase activity; INVOLVED IN: phosphate metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: nucleus, membrane, cytoplasm; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inorganic pyrophosphatase (InterPro:IPR008162); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pyrophosphorylase 3 (TAIR:AT2G46860.1); Has 5987 Blast hits to 5987 proteins in 1845 species: Archae - 172; Bacteria - 4313; Metazoa - 247; Fungi - 261; Plants - 270; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 724 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:31382..32670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24485.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 212 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSEETKDNQR LQRPAPRLNE RILSSLSRRS VAAHPWHDLE IGPGAPQIFN VVVEITKGSK VKYELDKKTG LIKVDRILYS SVVYPHNYGF VPRTLCEDND 101: PIDVLVIMQE PVLPGCFLRA RAIGLMPMID QGEKDDKIIA VCVDDPEYKH YTDIKELPPH RLSEIRRFFE DYKKNENKEV AVNDFLPSES AVEAIQYSMD 201: LYAEYILHTL RR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)