ATMG00290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitochondrial ribosomal protein S4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a mitochondrial ribosomal protein S4, a constituent of the small subunit of the ribosomal complex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mitochondrial ribosomal protein S4 (RPS4); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, protein binding; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial small ribosomal subunit; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: RNA-binding S4 (InterPro:IPR002942); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Alpha-L RNA-binding motif/Ribosomal protein S4 family protein (TAIR:AT2G07734.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrM:-:82028..83116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43028.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 362 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWLLKKLIQR DIDLSPLRFQ TCRLLSGNVR NRELTIIQRR ILRRLRNRKR SIKKRKIYPK KYLTSYIQLQ TTRKLPLFHG DLPITEMHRG TKRTSYIPFP 101: LNPETRFDVI PLRLHFLETI PQARQPISHR RVCVNKGMVS ITHFKLSHGD IISFQENNAI IRGEEIRRSF YKEISVEKII GKLLHQPLRM WRRSKTEWFH 201: LLKTKRGCRL LLKSRFLQQL RSSMQEEDLE RTKKFGSEKV CLGSSFAEHK RMKRNLLKSL FLSKRRKDKN LNLPTRTISP IVYNSSLSLY SNSTYCFASP 301: HKLTMKRRIK RIELPTHYSE VNHRTPKAVV SYGPNIGHIP HDIRLKDPNL PLRSRNGRGQ NI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)