ATCG00900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S7p/S5e family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a chloroplast ribosomal protein S7, a constituent of the small subunit of the ribosomal complex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RPS7.1; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: plastid small ribosomal subunit, chloroplast; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S7, bacterial-type (InterPro:IPR005717), Ribosomal protein S7, conserved site (InterPro:IPR020606), Ribosomal protein S7 (InterPro:IPR000235); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ribosomal protein S7 (TAIR:ATCG01240.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:97478..97945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17358.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 155 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRRGTAEEK TAKSDPIYRN RLVNMLVNRI LKHGKKSLAY QIIYRALKKI QQKTETNPLS VLRQAIRGVT PDIAVKARRV GGSTHQVPIE IGSTQGKALA 101: IRWLLGASRK RPGRNMAFKL SSELVDAAKG SGDAIRKKEE THRMAEANRA FAHFR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)