AT5G57850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein; FUNCTIONS IN: 4-amino-4-deoxychorismate lyase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: tetrahydrofolate biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aminotransferase, class IV (InterPro:IPR001544); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein (TAIR:AT3G05190.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23435548..23437287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41067.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 373 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGLSLEFTV NTWNLRSLSQ VPCPLRHGFR FPRRLTRRRT ILMCSDSSSQ SWNVPVLSSY EVGERLKLAR GGQQFLAMYS SVVDGITTDP AAMVLPLDDH 101: MVHRGHGVFD TALIINGYLY ELDQHLDRIL RSASMAKIPL PFDRETIKRI LIQTVSVSGC RDGSLRYWLS AGPGDFLLSP SQCLKPTLYA IVIKTNFAIN 201: PIGVKVVTSS IPIKPPEFAT VKSVNYLPNV LSQMEAEAKG AYAGIWVCKD GFIAEGPNMN VAFVVNGGKE LVMPRFDNVL SGCTAKRTLT LAEQLVSKGI 301: LKTVKVMDVT VEDGKKADEM MLIGSGIPIR PVIQWDEEFI GEGKEGPIAK ALLDLLLEDM RSGPPSVRVL VPY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)