AT5G48740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.986 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: LP.04 four leaves visible, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT1G67720.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:19765324..19769314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 99618.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 895 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLFWVLLSSF CVFCFSSPDG FLSLSCGGSS YTAAYNISWV SDNDYIETGN TTTVTYAEGN STSSVPIRLF PDPQGRQCYK LPVRKDLSSV LIRATFVYRN 101: YDSQNSPPAF HVSLGRRITS TVDLRTNDPW IEELVWPVNN DSLLLCLLAV KGRGIPVISS LEVRPLPLGS YKYSLEGSPD IILRRSYRIN SGYTNGTIRY 201: PSDPFDRIWD PDQSYSPFHA SWSFNGLTKL NSFNITENPP ASVLKTARIL ARKESLSYTL SLHTPGDYYI ILYFAGILSL SPSFSVTIND EVKQSDYTVT 301: SSEAGTLYFT QKGISKLNIT LRKIKFNPQV SALEVYEILQ IPPEASSTTV SALKVIEQFT GQDLGWQDDP CTPLPWNHIE CEGNRVTSLF LSKINLRSIS 401: PTFGDLLDLK TLDLHNTSLT GAIQNVGSLK DLQKLNLSFN QLESFGSELE DLVNLEVLDL QNNSLQGSVP ETLGKLKKLR LLNLENNNLV GPLPQSLNIT 501: GLEVRITGNP CLSFSSISCN NVSSTIDTPQ VTIPINKKQR KQNRIAILLG VSGGALFATF LVFVFMSIFT RRQRNKERDI TRAQLKMQNW NASRIFSHKE 601: IKSATRNFKE VIGRGSFGAV YRGKLPDGKQ VAVKVRFDRT QLGADSFINE VHLLSQIRHQ NLVSFEGFCY EPKRQILVYE YLSGGSLADH LYGPRSKRHS 701: LNWVSRLKVA VDAAKGLDYL HNGSEPRIIH RDVKSSNILL DKDMNAKVSD FGLSKQFTKA DASHITTVVK GTAGYLDPEY YSTLQLTEKS DVYSFGVVLL 801: ELICGREPLS HSGSPDSFNL VLWARPNLQA GAFEIVDDIL KETFDPASMK KAASIAIRCV GRDASGRPSI AEVLTKLKEA YSLQLSYLAA SAHTD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)