AT5G42810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.957 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : inositol-pentakisphosphate 2-kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an inositol tetra-/pentaphosphate 2-kinase, involved in the biosynthesis of phytic acid, a regulator of intracellular signaling, a highly abundant animal antinutrient, and a phosphate and mineral storage compound in plant seeds. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
inositol-pentakisphosphate 2-kinase 1 (IPK1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase, metazoa (InterPro:IPR018009), Inositol-pentakisphosphate 2-kinase (InterPro:IPR009286); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase family protein (TAIR:AT1G22100.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:17167073..17169337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50512.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 451 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMILEEKDA SDWIYRGEGG ANLVLAYAGS SPLFVGKVIR IQKARRNDKA IKNANGVVSV LTSDEQHLWR ENNELISSPN KEVLEQRYVK NVIIPLLGPK 101: HVDAGVRVSV SKEFLECVDK KVTKQRPLWR VNAANVDTSH DSALILNDHS LFSQGISSGG DCISVEIKPK CGFLPTSRFI GKENMLKTSV SRFKMHQLLK 201: LEYNEISEES EYDPLDLFSG SKESVLEAIK ALYSTPQNNF RVFLNGSLIL GGSGESTGRT SPEIGYAFED ALKGFIQSED GHRTECFLQL VSDAVYGSGV 301: LDRLLEIQKL DKLDIEGAIH SYYDLINQPC PICKEGKPLE AELSLHALPL DESLKIVKEY LIAATAKDCS IMISFQSRNA WDSEPSGDYV SLKPTNQTFD 401: YKVHFIDLSL KPLKRMESYY KLDKKIISFY NRKQKAENTA EQIGNSKPSH S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)