AT5G34930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arogenate dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
arogenate dehydrogenase; FUNCTIONS IN: binding, prephenate dehydrogenase (NADP+) activity, catalytic activity; INVOLVED IN: tyrosine biosynthetic process, metabolic process; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prephenate dehydrogenase (InterPro:IPR003099), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: prephenate dehydrogenase family protein (TAIR:AT1G15710.1); Has 1942 Blast hits to 1528 proteins in 619 species: Archae - 162; Bacteria - 1128; Metazoa - 21; Fungi - 62; Plants - 205; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 364 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:13233391..13235522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72304.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 640 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAETLITKPP LSLSFTSLSS MLPSLSLSTA NRHLSVTDTI PLPNSNSNAT PPLRIAIIGF GNYGQFLAET LISQGHILFA HSRSDHSSAA RRLGVSYFTD 101: LHDLCERHPD VVLLCTSILS IENILKTLPF QRLRRNTLFV DVLSVKEFAK TLLLQYLPED FDILCTHPMF GPQSVSSNHG WRGLRFVYDK VRIGEERLRV 201: SRCESFLEIF VREGCEMVEM SVTDHDKFAA ESQFITHTLG RLLGMLKLIS TPINTKGYEA LLDLAENICG DSFDLYYGLF VYNNNSLEVL ERIDLAFEAL 301: RKELFSRLHG VVRKQSFEGE AKKVHVFPNC GENDASLDMM RSEDVVVKYE YNSQVSGSVN DGSRLKIGIV GFGNFGQFLG KTMVKQGHTV LAYSRSDYTD 401: EAAKLGVSYF SDLDDLFEEH PEVIILCTSI LSTEKVLESL PFQRLKRSTL FVDVLSVKEF PRNLFLQTLP QDFDILCTHP MFGPESGKNG WNNLAFVFDK 501: VRIGMDDRRK SRCNSFLDIF AREGCRMVEM SCAEHDWHAA GSQFITHTVG RLLEKLSLES TPIDTKGYET LLKLVENTAG DSFDLYYGLF LYNPNAMEQL 601: ERFHVAFESL KTQLFGRLHS QHSHELAKSS SPKTTKLLTS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)