AT5G24430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Calcium-dependent protein kinase (CDPK) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Calcium-dependent protein kinase (CDPK) family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Calcium-dependent protein kinase (CDPK) family protein (TAIR:AT3G49370.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:8339390..8342913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66517.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 594 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGHCYSRNIS AVEDDEIPTG NGEVSNQPSQ NHRHASIPQS PVASGTPEVN SYNISPFQSP LPAGVAPSPA RTPGRKFKWP FPPPSPAKPI MAALRRRRGA 101: PPQPRDEPIP EDSEDVVDHG GDSGGGERLD KNFGFGKNFE GKYELGKEVG RGHFGHTCWA KAKKGKMKNQ TVAVKIISKA KMTSTLSIED VRREVKLLKA 201: LSGHRHMVKF YDVYEDADNV FVVMELCEGG ELLDRILARG GRYPEVDAKR ILVQILSATA FFHLQGVVHR DLKPENFLFT SRNEDAILKV IDFGLSDFIR 301: YDQRLNDVVG SAYYVAPEVL HRSYSTEADM WSIGVISYIL LCGSRPFYGR TESAIFRCVL RANPNFEDMP WPSISPTAKD FVKRLLNKDH RKRMTAAQAL 401: AHPWLRDENP GLLLDFSVYK LVKSYIRASP FRRSALKALS KAIPDEELVF LKAQFMLLDP KDGGLSLNCF TMALTRYATD AMMESRLPDI LNTMQPLAQK 501: KLDFEEFCAA AVSVYQLEAL EEWEQIATSA FEHFEHEGNR IISVQELAGE MSVGPSAYPL LKDWIRSSDG KLSFLGYAKF LHGVTVRSSS SRPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)