AT5G21430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Chaperone DnaJ-domain superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Chaperone DnaJ-domain superfamily protein; FUNCTIONS IN: heat shock protein binding; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), Heat shock protein DnaJ, N-terminal (InterPro:IPR001623); Has 75 Blast hits to 75 proteins in 29 species: Archae - 0; Bacteria - 23; Metazoa - 6; Fungi - 2; Plants - 34; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 10 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7222294..7223400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24439.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 218 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLSTITQP SLVHIPGESV LHHVPSTCSF PWKPTINTKR IICSPARNSS EVSAEAETEG GSSTAVDEAP KESPSLISAL NVERALRGLP ITDVDHYGRL 101: GIFRNCSYDQ VTIGYKERVK ELKEQGLDEE QLKTKMDLIK ESYTILSTVE ERRMYDWSLA RSEKAERYVW PFEVDIMEPS REEPPPQEPE DVGPTRILGY 201: FIGAWLVLGV ALSVAFNR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)