AT5G15860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.600 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prenylcysteine methylesterase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with prenylcysteine methylesterase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
prenylcysteine methylesterase (PCME); FUNCTIONS IN: prenylcysteine methylesterase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carboxylesterase type B, active site (InterPro:IPR019826), Carboxylesterase, type B (InterPro:IPR002018), Alpha/beta hydrolase fold-3 (InterPro:IPR013094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT3G02410.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5178676..5181263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47584.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 427 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHSPLQTQQP EQRCWPMTST VSEIEEVLPD EDSDRTTLLN GEPLRRRVSG KSPVDEGPRR IFRQQSFGRD IGHAAAETYL ITGLSFKLLR YLGVGYRWMT 101: KLLALTCYAM LLMPGFLQVA YSYFFSKQVR RSIVYGDQPR NRLDLYLPSN NDGLKPVVVF VTGGAWIIGY KAWGSLLGMQ LAERDIIVAC LDYRNFPQGT 201: ISDMVTDASQ GISFVCNNIS AFGGDPNRIY LMGQSAGAHI AACALLEQAT KELKGESISW TVSQIKAYFG LSGGYNLYKL VDHFHNRGLY RSIFLSIMEG 301: EESFEKFSPE VRLKDPVVGK AASLLPPIIL FHGSSDYSIP CDESKTFTDA LQAVGAKAEL VLYSGKTHTD LFLQDPLRGG KDELFDDIVS VIHAEDNDGL 401: TKDSLAPPRK RLVPELLLKL AREISPF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)