AT5G14180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Myzus persicae-induced lipase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Myzus persicae-induced lipase 1 (MPL1); FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN: glycerol biosynthetic process, lipid metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 7 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: AB-hydrolase-associated lipase region (InterPro:IPR006693), Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lipase 1 (TAIR:AT2G15230.1); Has 1911 Blast hits to 1879 proteins in 244 species: Archae - 0; Bacteria - 109; Metazoa - 1225; Fungi - 283; Plants - 181; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 113 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4571442..4574413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46050.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 418 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGSVMVPSV SIGLALSVLI FFALSLKTLE ARGTFGRLAG QPPQRTAAGG ICASSVHIFG YKCEEHDVVT QDGYILNMQR IPEGRAGAVA GDGGKRQPVL 101: IQHGILVDGM SWLLNPADQN LPLILADQGF DVWMGNTRGT RFSRRHKYLN PSQRAFWNWT WDELVSYDLP AMFDHIHGLT GQKIHYLGHS LGTLIGFASF 201: SEKGLVDQVR SAAMLSPVAY LSHMTTVIGD IAAKTFLAEA TSILGWPEFN PKSGLVGDFI KAICLKAGID CYDLVSVITG KNCCLNASTI DLFLANEPQS 301: TSTKNMIHLA QTVRDKELRK YNYGSSDRNI KHYGQAIPPA YNISAIPHEL PLFFSYGGLD SLADVKDVEF LLDQFKYHDI DKMNVQFVKD YAHADFIMGV 401: TAKDVVYNQV ATFFKRQA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)