AT5G09640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a serine carboxypeptidase-like (SCPL) protein. Mutants accumulate sinapoylglucose instead of sinapoylcholine, and have increased levels of choline and decreased activity of the enzyme sinapoylglucose:choline sinapoyltransferase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 19 (SCPL19); FUNCTIONS IN: sinapoyltransferase activity, serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, secondary metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: seed; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 3 (TAIR:AT1G73280.1); Has 3721 Blast hits to 3663 proteins in 396 species: Archae - 0; Bacteria - 292; Metazoa - 624; Fungi - 837; Plants - 1544; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 424 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:2988373..2990966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52581.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRNLSFIVLF LLTLFFIHHL VDASLLVKSL PGFEGPLPFE LETGYVSIGE SGDVELFYYF VKSERNPEND PLMIWLTGGP GCSSICGLLF ANGPLAFKGD 101: EYNGTVPPLE LTSFSWTKVA NILYLEAPAG SGYSYAKTRR AFESSDTKQM HQIDQFLRSW FVKHPEFISN PFYVGGDSYS GKIVPGAVQQ ISLGNEKGLT 201: PLINIQGYVL GNPVTDKNIE TNYRVPFAHG MGLISDELFE SLERSCGGKF FNVDPSNARC SNNLQAYDHC MSEIYSEHIL LRNCKVDYVL ADTPNIRTDR 301: RRVMKEFSVN DSSSLPPPSC FTYRYFLSAF WANDENVRRA LGVKKEVGKW NRCNSQNIPY TFEIFNAVPY HVNNSLKGFR SLIYSGDHDS MVPFSSTQAW 401: IRALNYSIVD DWRPWMMSSN QVAGYTRTYA NKMTFATIKG GGHTAEYTPD QCSLMFRRWI DGEPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)