AT5G05920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : deoxyhypusine synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a deoxyhypusine synthase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
deoxyhypusine synthase (DHS); INVOLVED IN: embryo sac development, peptidyl-lysine modification to hypusine; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Deoxyhypusine synthase (InterPro:IPR002773); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:1777781..1779699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41065.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 368 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEDDRVFSSV HSTVFKESES LEGKCDKIEG YDFNQGVDYP KLMRSMLTTG FQASNLGEAI DVVNQMLDWR LADETTVAED CSEEEKNPSF RESVKCKIFL 101: GFTSNLVSSG VRDTIRYLVQ HHMVDVIVTT TGGVEEDLIK CLAPTFKGDF SLPGAYLRSK GLNRIGNLLV PNDNYCKFED WIIPIFDEML KEQKEENVLW 201: TPSKLLARLG KEINNESSYL YWAYKMNIPV FCPGLTDGSL GDMLYFHSFR TSGLIIDVVQ DIRAMNGEAV HANPKKTGMI ILGGGLPKHH ICNANMMRNG 301: ADYAVFINTG QEFDGSDSGA RPDEAVSWGK IRGSAKTVKV YCDATIAFPL LVAETFATKR DQTCESKT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)