AT5G01220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfoquinovosyldiacylglycerol 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
involved in sulfolipid biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfoquinovosyldiacylglycerol 2 (SQD2); FUNCTIONS IN: UDP-glycosyltransferase activity, UDP-sulfoquinovose:DAG sulfoquinovosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: cellular response to phosphate starvation, sulfolipid biosynthetic process, glycolipid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, group 1 (InterPro:IPR001296); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT5G59070.1); Has 35941 Blast hits to 35876 proteins in 3155 species: Archae - 1250; Bacteria - 26211; Metazoa - 142; Fungi - 236; Plants - 1690; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 6410 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:86907..89885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56633.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 510 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTLSSINLS IPPHLLPSTT NTCSSSSATS CSPPRSSSFV LHSPLSFGHR RLPISKKSKL RFCGVITKEA VSGSNDMTIT QVREDDESEI DAPLLDPESL 101: SKPRRIALFV EPSPFAYVSG YKNRFQNFIR YLREMGDEVI VVTTHEGVPE EFYGARVIGS RSFPCPYYQK VPLSLALSPR IISEIARFKP DIIHASSPGV 201: MVFGALAIAK MLSVPIVMSY HTHVPVYIPR YTFSWLVKPM WSIIRFLHRA ADLTLVPSAA IGKDLIAAGA TAANQLRLWN KGVDSESFNP RFRSQEMRIR 301: LSNGEPEKPL VIHVGRIGVE KSLELLKSVM DKLPEARIAF IGDGPYKEDL EKLFTGMPAV FTGTLQGDEL SQAYASGDVF VMPSESETLG LVVLEAMSSG 401: LPVVAARAGG IPDIIPEDQE GKTGFLFNPG DVEDCVTKLR TLLHDRETRE IIGKAAREET EKYDWRAATT KIRNEQYSAA IWFWRKKKVH VLGPINWLIK 501: RLFPVPEGNV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)