AT4G39640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : gamma-glutamyl transpeptidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
The gene encodes a gamma-glutamyltransferase (AKA gamma-glutamyl transpeptidase, EC 2.3.2.2) that is located in vascular tissues (predominantly phloem) of leaves and is involved in the degradation of glutathione. The encoded enzyme also mitigates oxidative stress by metabolizing GSSG (oxidized form of GSH - glutathione) in the apoplast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
gamma-glutamyl transpeptidase 1 (GGT1); FUNCTIONS IN: gamma-glutamyltransferase activity, glutathione gamma-glutamylcysteinyltransferase activity; INVOLVED IN: response to oxidative stress, glutathione catabolic process; LOCATED IN: apoplast, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Gamma-glutamyltranspeptidase (InterPro:IPR000101); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gamma-glutamyl transpeptidase 2 (TAIR:AT4G39650.1); Has 9168 Blast hits to 9144 proteins in 1483 species: Archae - 86; Bacteria - 4247; Metazoa - 703; Fungi - 305; Plants - 110; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 3716 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:18400608..18402861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61193.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 572 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLVRTVTIV LFIIAFLQNA AAQKRQQSIV KSRGAVATDD GRCSVIGMRV LREGGNAIDA SVAAALCLGV VSPASSGIGG GAFTVVKIAG GKEIAYDSRE 101: TAPLRATENM YGGNVDLKKK GALSVGVPGE VAGLFTAWKQ HGKLPWKRLV TPAEKLAEGF KISKYLYMQM NATRSDILAD KGLSDLFVSN GELKKPGTIC 201: HNPKLALTLK LIGEYGPKAF YNGTVGVNLA RDIKKSGGII TLKDLQSYRV KIKEPLSADI LGYRVLGMPP PSSGGAAMML VLNILSQYGI PSGVSGPLGV 301: HRLIEALKHA FAVRMNLGDP DFTDVTKVVS DMLSPKFAKD LKSKINDQKT FDPKYYGGMW NQIDDHGTSH LSIIDRERNA VSMTSTINGY FGALMLSPST 401: GIVLNNEMDD FSIPMKSNGN LDVPPPAPAN FIRPGKRPLS SMSPTIVLKD GKVKAAVGAS GGANIIAGTT EVYLNHFFLK MDPLSSVLAP RIYHQLIPNR 501: ASYENWTTVF NDHFEIPKAT RVVLEKKGHV LSPIAGGTIA QFIVQESGEN SGGRSELVAV SDPRKGGFPS GY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)