AT4G36160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAC domain containing protein 76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a NAC-domain transcription factor. Expressed in the vascular tissue. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAC domain containing protein 76 (NAC076); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: No apical meristem (NAM) protein (InterPro:IPR003441); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vascular related NAC-domain protein 1 (TAIR:AT2G18060.1); Has 3021 Blast hits to 3016 proteins in 76 species: Archae - 0; Bacteria - 1; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 3020; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17110877..17112891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43519.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 377 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESVDQSCSV PPGFRFHPTD EELVGYYLRK KVASQKIDLD VIRDIDLYRI EPWDLQESCR IGYEERNEWY FFSHKDKKYP TGTRTNRATM AGFWKATGRD 101: KAVYDKSKLI GMRKTLVFYK GRAPNGQKTD WIMHEYRLES DENAPPQEEG WVVCRAFKKK PMTGQAKNTE TWSSSYFYDE LPSGVRSVTE PLNYVSKQKQ 201: NVFAQDLMFK QELEGSDIGL NFIHCDQFIQ LPQLESPSLP LTKRPVSLTS ITSLEKNKNI YKRHLIEEDV SFNALISSGN KDKKKKKTSV MTTDWRALDK 301: FVASQLMSQE DGVSGFGGHH EEDNNKIGHY NNEESNNKGS VETASSTLLS DREEENRFIS GLLCSNLDYD LYRDLHV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)