AT4G31370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.555 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FASCICLIN-like arabinogalactan protein 5 precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
fasciclin-like arabinogalactan-protein, putative (FLA5) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FASCICLIN-like arabinogalactan protein 5 precursor (FLA5); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: anchored to membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAS1 domain (InterPro:IPR000782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FASCICLIN-like arabinogalactan protein 3 precursor (TAIR:AT2G24450.1); Has 2362 Blast hits to 1863 proteins in 310 species: Archae - 0; Bacteria - 554; Metazoa - 321; Fungi - 257; Plants - 835; Viruses - 150; Other Eukaryotes - 245 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15223838..15224674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29918.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 278 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLKASLSLL SLTILLVFSK VVTANNITLA FQKYSKFSTM RDLFIKTKLI AAIDKYQTIT VLAVSNDAIS SITNRSEVEL RNILMTHVIL DYYDELKLQG 101: MREKSIMLTT LYQTTGLGEQ MNGFLNVSKS KGRVYFGSEV KNSPLNAEYV STVYHNPYNL SIIQITMPIV APGLSLAIFP PPPPYVHVAP YPTPMDASVV 201: PAPGPAADDN SPDSAVPKTP PAPATDTPEA DSPAPAPSAD NEKIEAADKA KPSSSASKAG WSFDVILLLA FLASFAGF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)