AT4G30920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytosol aminopeptidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytosol aminopeptidase family protein; FUNCTIONS IN: manganese ion binding, metalloexopeptidase activity, aminopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, protein metabolic process; LOCATED IN: chloroplast, vacuole; EXPRESSED IN: guard cell, cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M17, leucyl aminopeptidase, C-terminal (InterPro:IPR000819), Peptidase M17, leucyl aminopeptidase, N-terminal (InterPro:IPR008283), Peptidase M17, leucyl aminopeptidase (InterPro:IPR011356); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytosol aminopeptidase family protein (TAIR:AT4G30910.1); Has 9817 Blast hits to 9813 proteins in 2024 species: Archae - 18; Bacteria - 5432; Metazoa - 663; Fungi - 36; Plants - 122; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 3545 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15046589..15049304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61310.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 583 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVTLVTSFA SSSSRFHFRS FSSSPSSLSS CFVRFQFPSR LRLAFAVTPL YSSSRAMAHT ISHATLGLTQ ANSVDHPKIS FSGKEIDVTE WKGDILAVGV 101: TEKDMAKDVN SKFENPILKK LDAHLGGLLA DVSSEEDFSG KPGQSTVLRL PGLGSKRVGL IGLGKSASTP SAFQSLGEAV AAAAKASQAS SVAVVLASSE 201: SVSNESKLCS ASAIASGTVL GLFEDSRYKS ESKKPSLKSV DIIGFGSGPE LEKKLKYAEH VSYGVIFGKE LVNSPANVLT PAVLAEEALN LASMYSDVMT 301: ANILNEEQCK ELKMGSYLAV AAASANPPHF IHLIYKPSSG PVKTKLALVG KGLTFDSGGY NIKTGPGCLI ELMKFDMGGS AAVLGAAKAI GQIKPPGVEV 401: HFIVAACENM ISGTGMRPGD VLTASNGKTI EVNNTDAEGR LTLADALVYA CNQGVDKVVD LATLTGACII ALGTSMAGIY TPSDKLAKEV IAASERSGEK 501: LWRMPMEESY WEMMKSGVAD MVNTGGRAGG SITAALFLKQ FVSEDVEWMH IDMAGPVWNE KKKAATGFGV ATLVEWVQNH SSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)