AT4G25950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar ATP synthase G3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
V-ATPase G-subunit like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar ATP synthase G3 (VATG3); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances; INVOLVED IN: proton transport; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Vacuolar (H+)-ATPase G subunit (InterPro:IPR005124); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vacuolar membrane ATPase 10 (TAIR:AT3G01390.2); Has 543 Blast hits to 543 proteins in 176 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 270; Fungi - 119; Plants - 123; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 31 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13173815..13174324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12116.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 108 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSLRGQGGI QMLLTAEQEA GRIVSAARTA KLARMKQAKD EAEKEMEEYR SRLEEEYQTQ VSGTDQEADA KRLDDETDVR ITNLKESSSK VSKDIVKMLI 101: KYVTTTAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)