AT4G23660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : polyprenyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes para-hydroxy benzoate polyprenyl diphosphate transferase. The enzyme was shown to be able to use a wide range of prenyl substrates : from GPP (C10) to decaprenyl diphosphate (C50). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
polyprenyltransferase 1 (PPT1); FUNCTIONS IN: 4-hydroxybenzoate nonaprenyltransferase activity; INVOLVED IN: ubiquinone biosynthetic process, embryo development; LOCATED IN: integral to membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase (InterPro:IPR006370), UbiA prenyltransferase (InterPro:IPR000537); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12328086..12331359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44605.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 407 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFFGLSRVS RRLLKSSVSV TPSSSSALLQ SQHKSLSNPV TTHYTNPFTK CYPSWNDNYQ VWSKGRELHQ EKFFGVGWNY RLICGMSSSS SVLEGKPKKD 101: DKEKSDGVVV KEASWIDLYL PEEVRGYAKL ARLDKPIGTW LLAWPCMWSI ALAADPGSLP SFKYMALFGC GALLLRGAGC TINDLLDQDI DTKVDRTKLR 201: PIASGLLTPF QGIGFLGLQL LLGLGILLQL NNYSRVLGAS SLLLVFSYPL MKRFTFWPQA FLGLTINWGA LLGWTAVKGS IAPSIVLPLY LSGVCWTLVY 301: DTIYAHQDKE DDVKVGVKST ALRFGDNTKL WLTGFGTASI GFLALSGFSA DLGWQYYASL AAASGQLGWQ IGTADLSSGA DCSRKFVSNK WFGAIIFSGV 401: VLGRSFQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)